בניית הקווים עצמם מתבצעת בשנים האחרונות ומורגשת היטב בקרב התושבים, שסובלים משיבושי תנועה ופקקים מתישים. כחלק מהפרויקט, בקיץ האחרון הרכבת הקלה גם הושבתה למשך 14 שבועות לצורך שדרוג תשתיות המסילה וחיבורן למערכת חדישה יותר על מנת שקרונות הקו הירוק יוכלו לעבור על המסילה הקיימת.
כמו כן, חלו עיכובים משמעותיים בביצוע העבודות שגרמו להתייקרות אדירה, בשל ונדליזם ומחאות של חרדים במקטע שיעבור בשכונות החרדיות שבמזרח העיר.
החברה שאמונה על הפרויקט היא חברת "מוריה" והגוף שמתכלל אותו הוא צוות אב לתחבורה בירושלים – גוף שפועל תחת עיריית ירושלים ומשרד התחבורה, ומתפקד כמעין "רשות תחבורה מטרופולינית" כלומר, הוא בעל סמכויות ותקציבים בנוגע לתכנון פרויקטי תחבורה ותשתיות בבירה.
מסלול הקו הירוק: הקו הירוק יהיה הראשון להיפתח, אך פתיחתו תהיה מדורגת. כרגע הפתיחה המשוערת היא במאי 2026 אולם הניסיון מלמד שמועד זה עשוי להתעכב. רק בחודש האחרון החלו נסיעות המבחן של המקטע המיועד.
הקו הירוק כולל 20 קילומטרים, שתי שלוחות כשבסך הכל יהיו בו 41 תחנות. הקו יחבר את שכונת גילה, אזור צומת פת וגבעת מרדכי, שכונת בית הכרם, התחנה המרכזית, שכונת רמת אשכול והגבעה הצרפתית ויגיע עד לקמפוס הר הצופים של האוניברסיטה העברית. לקו יש 2 שלוחות, הראשונה תגיע למלחה והשנייה תגיע להר נוף.
עלות: 9 מיליארד שקלים שלב ביצוע נוכחי: נסיעות מבחן של המקטע שיפתח, עבודות אינפרא 2 במקטעים האחרים תדירות הגעה: כל 6 דקות כמות נוסעים: 250,000 נוסעים ביום. מועד פתיחה: 2026 (פתיחה חלקית)
מסלול הקו הכחול: הקו הכחול ייפתח בשלב מאוחר יותר, והעבודות עליו מתבצעות בימים אלה. הוא יחל את נסיעתו בגילה, יעבור על דרך חברון ומשם ימשיך למרכז העיר ועד לשכונת רמות. לקו תהיה שולחה שתגיע גם משכונת אבו-טור לאזור תלפיות וקריית הממשלה, וכן התפצלות קטנה עד לשכונת רמת אשכול. בסך הכל הקו יתפרס לאורך 31 קילומטרים ויכלול 53 תחנות.
עלות: כ-10 מיליארד שקלים שלב ביצוע נוכחי: עבודות העתקת תשתיות בשלב אינפרא 1 תדירות הגעה: כל 6 דקות כמות נוסעים: 200,000 נוסעים ביום מועד פתיחה: 2029 פתיחה של המקטע הראשוני, 2031 פתיחה מלאה
אחד העניינים שגרמו לשיח בנוגע לפרויקט הקו הכחול היה הוויכוח סביב מקטע עמק רפאים. סוחרים ותושבים פנו לעירייה בדרישה לביטול התוואי ברחוב מחשש לפגיעה בעסקים בשל העבודות הארוכות.
המוחים עתרו לבית המשפט, שם הוחלט ב-2017 לקיים דיון מחודש על המקטע ולהחריגו מהפרויקט. ב-2020 לאחר מאבק משפטי וציבורי עיקש, הוחלט לדחות את הערעורים ולאשר את מעבר התוואי בעמק רפאים, אולם במסגרת של מסילת בודדת ולא כפולה
